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布魯克發(fā)布全新空間單細胞代謝組學研究策略
?創(chuàng)新的無偏原位空間單細胞代謝組學（SSCM）能夠以單細胞分辨率實現(xiàn)高通量代謝組織樣本表征；
* 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技術(shù)可在大視場內(nèi)提供幾乎無偽影的小分子圖像；
* 創(chuàng)新的 4D-代謝組學可通過 CCS-Predict Pro AI/DL 功能預(yù)測分子碰撞橫截面（CCS），進一步豐富脂質(zhì)、代謝物和糖苷的數(shù)據(jù)庫.
2022年6月21日西班牙瓦倫西亞 -- 在第 18 屆代謝組學學會國際會議上，布魯克公司（納斯達克股票代碼：BRKR）宣布了空間多組學的關(guān)鍵創(chuàng)新是無偏空間單細胞代謝組學（SSCM），它被用于探測基于組織和單細胞代謝特征的差異細胞表型。
SSCM 與最近發(fā)布的 MALDI HiPLEX-IHC 工作流程相結(jié)合，可用于原位單細胞免疫代謝組學研究，從而實現(xiàn)了將基于代謝組學的免疫重編程與靶向蛋白質(zhì)組學的整合。這種單細胞多組學工作流程基于 timsTOF fleX 系統(tǒng)的新型 microGRID smartbeam 3D MALDI 源，可用于亞微米定位、空間分辨率低至 5 微米（5 μm），幾乎消除了 MALDI 分子圖像與光學顯微鏡共定位中的任何偽影。
單細胞技術(shù)徹底改變了人們對癌癥、再生醫(yī)學、衰老和肝病背后的生物過程的異質(zhì)性的理解。研究細胞間組織變異可以加強轉(zhuǎn)化研究，例如，在癌癥研究方法領(lǐng)域，開發(fā)針對罕見腫瘤細胞的治療方法。
德國海德堡 EMBL 代謝組學核心設(shè)施和分子醫(yī)學合作部門負責人 Theodore Alexandrov 教授，將在丹麥哥本哈根生物創(chuàng)新研究所 BioStudio 工作室主持名為 SpaceM 的新項目，重點研究用于藥物開發(fā)和精準醫(yī)學的單細胞代謝組學。
Alexandrov 博士評論說：“我們正在將 EMBL 海德堡開發(fā)的 SpaceM 空間單細胞代謝組學技術(shù)，開發(fā)成為快速藥物發(fā)現(xiàn)的平臺。作為哥本哈根生物創(chuàng)新研究所 BioStudio 項目的一部分，我們將使用 timsTOF fleX MALDI-2 成像系統(tǒng)對單細胞進行快速、靈敏和特異性原位分析，以確定其代謝狀態(tài)。此外，最新的 microGRID 技術(shù)將為我們提供精準檢測單個細胞所需的高空間分辨率。
布魯克公司還推出了用于代謝組學分析與定量的新一代 MetaboScape? 和 TASQ? 軟件。MetaboScape 2022b 集成了 CCS-Predict Pro 機器學習算法，timsTOF 平臺上測量的準確且可重復的 CCS 值可以與從化合物庫或 biotransformation 算法中預(yù)測的 CCS 值相匹配，從而為化合物注釋添加了一個正交維度，使注釋結(jié)果更加可靠。
TASQ 2022b 的目標物篩查與定量的工作流程增加了同位素示蹤工作流程，同樣支持 CCS 值的匹配。由于提供了天然同位素的矯正方法和同位素標記分數(shù)貢獻等關(guān)鍵算法，大規(guī)模穩(wěn)定同位素示蹤實驗的數(shù)據(jù)處理得到簡化。
