1. 細胞富集/選擇?激光捕獲纖維切割、FRCS分型、磁珠捕獲可用于從組織或者標本中獲得相同類型的細胞，提高分子檢測的靈敏度和特異性。這些方法通常用于檢測循環(huán)腫瘤細胞，以監(jiān)測最小剩余疾?。∕RD），或者檢測母體血液中胎兒細胞。腫瘤細胞可采用特定的表面標志物從混合細胞中分離。細胞富集方法可通過以下方式實現(xiàn)：

? ??1）密度梯度離心分離外周血單克隆細胞（PBMCs）

? ??2）基于密度的細胞富集（淘洗）
? ??3）抗體富集（FACS、磁珠捕獲）
? ??4）激光捕獲微切割（LCM）
2. 病原體富集和濃縮方法?分子檢測的靈敏度通常通過擴增實現(xiàn)，一般不需要標本的富集或濃縮。利用巢氏擴增能最大程度地提高分子檢測的靈敏度，PCR中的富集也可指去除干擾抑制性物質(zhì)的過程。在實驗室中，標本病原體的富集利用重力和離心力來分離混合的血液、粘液、炎性物質(zhì)或其他干擾分子學分析的碎片。特殊情況，實驗室需要濃縮標本來富集病原體或游離的循環(huán)核酸進行擴增，可采用高速離心法或過濾法進行濃縮。
3. 核酸制備
? ??（1） 病毒核酸分離 病毒核酸的純化有一定的挑戰(zhàn)性，因為通常生物標本的病毒滴度較低，而蛋白或其他污染物較多。純化方法應提供定量的核酸恢復，并完全去除污染物。很多生物原始材料含有豐富的RNase，因此純化方法需要使用有效的RNase抑制劑。純化方法包括：有機提取方法、目標捕獲方法、硅技術法。如果臨床標本，如糞便、血漿、尿液、腦脊液或其他體液，通常僅包含少量的細胞或病毒，應對標本進行濃縮，可通過離心、過濾、陽離子表面活性劑等方法實現(xiàn)。
? ??（2） 基因組DNA分離 動物、人類、酵母、細菌細胞裂解液中的DNA提取方法同組織標本DNA提取類似。不同的原始材料含有的不同特征可能會影響DNA分離，標本的破碎和裂解對組織標本DNA的釋放也會造成一定的影響。破碎和裂解不完全會降低DNA產(chǎn)量。破碎通常采用裂解緩沖液，包括表面活性劑（破裂細胞膜）和蛋白酶（消化細胞或病原體中的蛋白）。有些細胞類型需要額外的處理才能有效裂解。利用注射器和細針使細胞或組織裂解液均一化。將裂解液通過0.9mm的針管可篩選高分子量DNA，加上無菌塑料注射器，至少5-10次，直到得到均一的裂解液。基因組DNA的提取方法很多，包括有機提取法、鹽析法、氯化銫密度梯度、硅方法、離子交換法、濾紙法，其基本原理是包括原始材料的破碎和裂解，繼而去除蛋白和其他污染物，最后恢復DNA。
? ??（3） RNA提取 RNA提取首先應使原始材料破碎和均質(zhì)化，一般使用有機溶劑或強解離劑，防止內(nèi)源性RNase的釋放。但在破碎和均值化過程中或之前，RNA的表達可能會發(fā)生改變。對于準確的基因表達分析，應先穩(wěn)定標本，需要添加RNase抑制劑。組織破碎和均值化方法包括定轉(zhuǎn)子均質(zhì)器、研磨珠、研缽、杵、旋轉(zhuǎn)柱均質(zhì)器等。RNA提取方法也很多，典型的方案是將幾種技術結合使用，根據(jù)特定的RNA類型、純度要求、每個標本的期望時間和成本、RNA是否需要保持完整選擇特定的方案，具體包括酶消化、有機提取、強變性劑提取、乙醇和LiCl沉淀、CsCl和蔗糖密度梯度、陰離子交換層析、硅方法、寡核苷酸（dT）親和層析等。