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DNA損傷的三種分子生物檢測方法

2020.1.31

DNA是攜帶生物體遺傳信息的重要分子,它的完整性對細(xì)胞存活至關(guān)重要。然而,在生命活動中,DNA時刻遭受著內(nèi)源性(氧化自由基、復(fù)制叉崩塌等)或外源性(電離輻射、烷化劑等)刺激,DNA損傷不可避免。

檢測DNA損傷的方法有很多,根據(jù)其原理大致可以分為3類:?基于損傷DNA理化性質(zhì)的改變檢測DNA損傷、基于分子雜交檢測DNA損傷以及基于DNA損傷后形成的產(chǎn)物檢測DNA損傷。前兩種方法是基于熒光標(biāo)記直接觀測DNA的損傷情況,而基于DNA損傷后形成的產(chǎn)物檢測DNA損傷是通過標(biāo)記物的檢測間接反映DNA的損傷程度。

檢測原理 檢測技術(shù) 所檢測DNA損傷類型
基于損傷DNA理化性質(zhì)的改變檢測 彗星實(shí)驗(yàn) 鏈斷裂及堿不穩(wěn)定位點(diǎn)
基于分子雜交檢測 熒光原位雜交法 鏈斷裂
基于DNA損傷后形
成產(chǎn)物檢測
yH2AX 鏈斷裂
8-OHdG DNA化學(xué)修飾
TUNEL 細(xì)胞凋亡所致DNA鏈斷裂

※?基于DNA損傷后形成產(chǎn)物進(jìn)行檢測

DNA損傷過程中可形成某些特定的損傷產(chǎn)物,可通過檢測損傷產(chǎn)物(磷酸化H2AX、8-OHdG等)來評估DNA損傷。也可標(biāo)記損傷DNA,如末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶介導(dǎo)的脫氧尿苷三磷酸標(biāo)記(terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated dUTP nick end labeling,TUNEL),通過標(biāo)記物的檢測間接反映DNA的損傷程度。

1.雙鏈斷裂標(biāo)志物磷酸化H2AX檢測法

H2AX是組蛋白H2A家族成員之一,包含一個進(jìn)化保守區(qū)域SQ位于真核細(xì)胞的C末端,分子量為14KD,139位有個絲氨酸殘基,在細(xì)胞發(fā)生DNA雙鏈斷裂后的數(shù)分鐘內(nèi),將會被ATM,ATR和PRKDC磷酸化,形成γH2AX,進(jìn)而迅速招募DNA修復(fù)蛋白和凋亡蛋白到損傷部位,每個雙鏈的斷裂區(qū)會有成百上千的γ-H2AX,然后在1h左右數(shù)量和密度達(dá)到峰值。由于γH2AX的出現(xiàn)與DNA雙鏈斷裂緊密關(guān)聯(lián),是目前國內(nèi)外研究細(xì)胞DNA雙鏈斷裂應(yīng)激反應(yīng)的熱點(diǎn)之一,同時也可以作為DNA雙鏈斷裂的標(biāo)志物。

由于與DNA雙鏈斷裂緊密相關(guān),γH2AX可以作為雙鏈修復(fù)的標(biāo)志物

H2AX&γH2AX相關(guān)抗體:

類型 貨號 名稱 應(yīng)用
H2AX抗體 MAB20144 H2AFX monoclonal antibody, clone BIA-8 WB-Ce、IHC-P、ICC、IF、IP
MAB12802 Histone H2AX monoclonal antibody, clone RM214 WB-Ce、ICC、ELISA
PAB8764 H2AFX polyclonal antibody WB-Ce、IHC、IP
γH2AX抗體 MAB15279 Histone H2AX (phospho S139) monoclonal antibody, clone 2A9-B5 WB-Ce、IF
MAB15111 Histone H2AX (phospho S139) monoclonal antibody, clone RM224 WB-Ce、ICC、IF
MAB21809 H2AFX (phospho S139) monoclonal antibody WB、?IHC-P、?IF、?IP

2.氧化損傷標(biāo)志物8-OHdG檢測法

DNA氧化損傷產(chǎn)物中,作為DNA中脫氧鳥苷(dG)的羥基加合物,8-羥基脫氧鳥苷(8-OHdG)因其形成量大,影響因素少,已被公認(rèn)為最能反映體內(nèi)DNA氧化損傷程度的生物標(biāo)志物。

3.DNA斷片標(biāo)記法

原位末端標(biāo)記法(TdT-mediated dUTP nick end labeling,TUNEL)是一種檢測凋亡細(xì)胞DNA鏈斷裂片段的方法。細(xì)胞凋亡發(fā)生時,內(nèi)源性核酸內(nèi)切酶將DNA降解成片段,在脫氧核苷酸末端轉(zhuǎn)移酶的作用下,底物dUTP 或BrDU(無或有熒光標(biāo)記)可連接到DNA斷片的3-OH末端,采用熒光顯微鏡或流式細(xì)胞儀對標(biāo)記物進(jìn)行分析,實(shí)現(xiàn)在單細(xì)胞水平檢測凋亡細(xì)胞的DNA碎片。




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